أحدثت الهيئة العامة للبحوث العلمية الزراعية بالقانون رقم 42 لعام 2001
وبموجب هذا القانون ضمت الهيئة مختلف الجهات العاملة في البحوث الزراعية في وزارة الزراعة والإصلاح الزراعي في سورية وهي:
- مديرية البحوث العلمية الزراعية .
- مديرية الري واستعمالات المياه .
- مديرية الأراضي .
- مديرية بحوث الإنتاج الحيواني .
- مديرية مكتب القطن .
- مديرية مكتب الزيتون .
- مديرية مكتب الحمضيات .
- مديرية مكتب الشوندر .
- مركز بحوث التفاحيات .
- قسم بحوث الحراج في مديرية الحراج .
الأمر الذي نقل البحوث الزراعية في سورية إلى موقع أكثر تطوراً ومكنها من تحديث هياكلها العلمية والإدارية وتطوير برامجها البحثية .
ويعول على الهيئة دور كبير بالمساهمة في تحديث الزراعة في سورية .