يهتم بإجراء بحوث الاصول الوراثية النباتية المزروعة والبرية وحفظها وتقييمها وتحديد مواصفاتها الشكليّة والفينولوجـــــــــية وأطوار حياتها من اجل استخدامها في برامج التحسين الوراثي.
استراتيجية القسم:
1- وضع البرامج التنفيذية للحفاظ على الموارد الوراثية النباتية وتنميتها ودراستها واستخدامها على نحو مستدام وتجنب الأخطار التي تهددها ومعالجتها.
2- جمع ومسح وحصر الموارد الوراثية النباتية ووضع خرائط توزعها.
3- توثيق وتقييم وتوصيف وتصنيف وإكثار وحفظ الموارد الوراثية النباتية وتزويد الإدارات البحثية بالموارد الوراثية للاستفادة منها في برامج التربية واستنباط الأصناف.
4- التعاون مع المراكز الوطنية والدولية في إطار اتفاقيات تبادل الموارد الوراثية مع البنوك الوراثية العربية والدولية.
5- الإشراف على تنفيذ أحكام القانون /20/ الخاص بحماية وتداول واستخدام الموارد الوراثية النباتية.
6- ضمان حقوق الجمهورية العربية السورية في اقتسام المنافع طبقاً للمعاهدة الدولية في هذا المجال.
الاسترتيجية الحالية:
1- حفظ عينات معشبية ممثلة للأنواع الموجودة في المعشبة.
2- إرسال عينات بذرية وحفظها في المركز الدولي للبحوث الزراعية في المناطق الجافة (إيكاردا) بما يعرف بالصندوق الأسود خارج سوريا ضمن اتفاقيات إيكاردا في هذا المجال وقد تم آخذ موافقة السيد الوزير على ذلك.
3- المحافظة على المجمعات الوراثية .
4- البدء بانشاء مخبر خاص بنشاطات الموارد الوراثية (لاختبار الحيوية، الرطوبة، والتنظيف والحفظ…).
5- تنفيذ جولات جمع للموارد الوراثية حسب الظروف الأمنية الحالية.
6- العمل بالقانون/20/الخاص بالموارد الوراثية.
ويتكون القسم من الدوائر التالية:
□ دائــــــــرة بحــــــوث الموارد الوراثية للمحاصيل:
وتتضمن:
شعبة الحبوب.
شعبة البقوليات.
شعبة المحاصيل الزيتية.
□ دائرة بحوث الموارد الوراثية للنباتات الرعوية
□ دائرة بحوث الموارد الوراثية للخضار
شعبة الخضار الشتوية.
شعبة الخضار الصيفية.
□ دائرة بحوث الموارد الوراثية للأشجار المثمرة
شعبة الأشجار متساقطة الأوراق.
شعبة الأشجار دائمة الخضرة.
□ دائرة (قسم) بحوث التصنيف النباتي والتنوع الحيوي
مخبر التقانات الحيوية.
المعشبة النباتية.
المجمعات الوراثية.
□ دائرة التوثيق
شعبة توثيق البيانات والنتائج.
شعبة التحليل.
□ دائرة حماية الموارد الوراثية
(التي نص القانون 20 على إنشاءها) وتتألف من الشعب التالية:
شعبة تبادل الأصول الوراثية.
شعبة التعاون والتنسيق.